近期,佐治亚大学教授Steven E. Wheeler博士和加利福尼亚大学旧金山分校药物化学教授Adam R. Renslo博士等在ChemRxiv上联合发表了一篇名为“A Comprehensive Empirical–Computational Study of Diverse Het-eroarene Stacking under Physiological Conditions”的研究论文。该文章研究了一系列含杂芳烃并能够结合procaspase-6二聚体的配体分子,通过晶体结构证实了其结合方式,再利用SPR(表面等离子共振)技术获得相互作用的平衡解离常数(Kd),并由此计算出实验结合自由能,同时通过计算方法预测结合亲和力,据此研究生理条件下的杂芳烃堆叠(Het-eroarene Stacking)相互作用。
(图片来源:ChemRxiv)
此研究是由生物医药初创企业、高等院校和CRO公司合作的一项成功案例。银河集团186net作为全球领先的一站式CRO-CDMO服务企业,自2020起与投资孵化的Elgia Therapeutics展开紧密合作,提供了化学合成,蛋白制备和结构分析以及SPR研究等服务,为研究提供了有力的科学论证支持。本次研究成果的成功发表,也体现了银河集团186net专业的研发能力和全面的服务能力。
杂芳烃堆叠相互作用有助于稳定蛋白质的三级结构,并且在药物结合、超分子化学和材料科学等领域起到重要作用。尽管科学家们已经使用了多种计算和实验方法来研究这些相互作用,但尚未发现一个更普遍有效的蛋白质-配体模型系统。作者研究了三十种合成配体,这些配体呈现出多样的杂芳烃探针,用于堆叠在 procaspase-6 二聚体界面上的对称性相关酪氨酸残基。作者在晶体学上证明堆叠几何在整个配体测试中高度守恒,并通过高精度计算表明配体结合自由能的差异主要归因于堆叠相互作用的相对强度。这项研究意义重大,因为它提供了一个广泛的数据基础,包括了在多样性蛋白质-配体系统中对自由能的经验研究和计算研究。更重要的是,这一研究也能够很好地衍生到对其他分子间相互作用的探讨中。(论文网址:https://chemrxiv.org/engage/chemrxiv/article-details/6390e8ac44ccbc311c11dd03)
银河集团186net化学部副主任孙德谦博士表示:“针对杂芳烃堆叠相互作用,找到更为普遍有效的蛋白质-配体模型系统一直是困扰科学家们已久的一大难题。银河集团186net化学团队很高兴能够参与本次研究中procaspase-6二聚体配体分子的合成。银河集团186net化学技术平台为客户提供了高效、可靠的合成服务,成功完成了多种研究所需化合物配体的合成。”
银河集团186net生物部高级主任赵岩龙博士表示:“我们就蛋白生产制备和结构研究与Elgia Therapeutics展开了紧密的合作,这对银河集团186net团队来说是一次非常有益的经验。我们凭借自身强大的蛋白研究能力,通过齐全的蛋白表达系统高效完成了procaspase-6三聚体的表达与纯化,从源头上保证蛋白样品的稳定性和均一性,为药物靶标蛋白结构解析提供坚实的基础。”
银河集团186net生物部副主任杨晶晶先生表示:“我们SPR团队提供了高效的化合物与蛋白亲和力检测,从早期实验设计到后续的数据报告交付的全流程服务。对于这个全新靶点,此前无相关SPR实验可供参考,我们开创性地设计了针对新靶点的检测方法。基于银河集团186netSPR独有的自动化配样及Biacore 8K的高通量筛选平台,极大提升了化合物的筛选效率。”
参考来源:
https://chemrxiv.org/engage/chemrxiv/article-details/6390e8ac44ccbc311c11dd03
关于Elgia Therapeutics
Elgia Therapeutics是一家临床前阶段的生物科技公司,致力于研发治疗慢性炎症和纤维化疾病的新疗法。Elgia Therapeutics由多名在先天免疫、代谢综合征、炎症及药物发现等领域的世界知名科学家创立。Elgia Therapeutics将使用高通量化学筛选结合基于结构设计的方法来发现和开发针对这些靶标的新型抑制剂。
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