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Crystal soaking技术

Crystal soaking（晶体浸泡法）筛选片段化合物是基于片段化合物药物发现的一个重要手段，此技术通常要求获得的药物靶标蛋白的晶体结构>2.5埃分辨率。实验流程上，我们通常先生长靶标蛋白单晶，然后把蛋白单晶浸泡在化合物中一段时间，再捞出蛋白晶体进行液氮冷冻保存，随后把蛋白晶体送至同步辐射光源收集晶体衍射数据，最后我们会基于晶体衍射数据分析，为客户提供片段化合物与蛋白结合的复合晶体结构，并向客户提交报告及相关结构数据文件。

高通量晶体浸泡

基于Crystal soaking的DNA解旋酶案例

案例中的DNA解旋酶结构，由ATP结合域和C-末端结构域组成，具有ATP结合位点和已知的阳性化合物结合位点，氨基酸序列长度为633，分子量达到76602Da。

银河集团186net研发团队采用气相扩散法在一定PEG条件下生长蛋白Apo晶体（平均分辨率达2.2Å），再将生长出来的280个晶体与银河集团186net自有960个化合物的片段化合物库浸泡在一起16个小时后，收集了258个晶体-化合物数据集。在除去分辨率不及3Å的数据集后，最后收集到244个数据进行PanDDA分析。且在此实验中，共筛选出11个结合位点，960个化合物的片段化合物库命中率达到4.3%。